Mithilfe der ‚recursively partitioned mixture model‘ (RPMM)-Klassifizierung der neun CpG-Loci in den 230 Proben der Testserie ergaben sich sieben Methylierungsklassen. Die Klassenzugehörigkeit in der Testreihe zeigte eine signifikante Korrelation mit dem Fall-Kontroll-Status (p <0,0001). Für jeden der neun CpG-Loci war der Methylierungsgrad bei den Fällen größer als bei den Kontrollen. Die Effektivität der Klassifizierung wurde anhand von ‚receiver operating characteristic‘ (ROC)-Kurven überprüft. Für die Methylierungsklasse alleine betrug die ‚area under curve‘ (AUC) 0,70. Nach Korrekturen für Alter, Geschlecht, Raucherstatus und familiäres Vorkommen von Blasenkrebs stieg die AUC auf 0,76. Die Zugehörigkeit zu drei der am meisten methylierten Klassen war mit einem 5,2-fach erhöhten korrigierten Risiko für Blasenkrebs behaftet.

Marsit CJ, Koestler DC, Christensen BC, et al. 2011. DNA methylation array analysis identifies profiles of blood-derived DNA methylation associated with bladder cancer. J Clin Oncol 29:1133-1139.

September 2011   red.drucken